Kegiatan Ekstrakurikuler di Pondok Pesantren ‘Ainurrafiq dikelompokkan ke dalam 3 Jenis kegiatan, yaitu : 1. Ilmiah dan Keterampilan, meliputi :
  • Kajian Agama (Musyawarah)
  • Arabic Club
  • English Club
  • MIPA Club
  • Pidato 3 Bahasa
  • Karya Ilmiah Santri (KIS)
  • Computer Club
  • Pramuka, dlll
2. Olahraga, meliputi :
  • Pencak Silat
  • Futsal
  • Basket
  • Volleyball
  • Badminton
  • Pecinta Alam, dll.
3. Seni, meliputi :
  • Marawis
  • Hadroh
  • Nasyid
  • Jami’atul Quro
  • Kaligrafi
  • Drumband, dll